asancpt/subintern

📝 2016, 2017, 2018, 2019 서울아산병원 임상약리학과에 실습 나온 것을 환영합니다. 서브인턴들의 교육을 위해 필요한 자료를 모아두었습니다.

Subinterns of Asan Medical Center

서울아산병원 임상약리학과 서브인턴을 위해 사용되는 저장소입니다.
This repository is used for teaching subinterns (students) of Dept of Clinical Pharmacology and Therapeutics, Asan Medical Center, Seoul.

오자마자 여러분이 해야할 일

• Github에 계정을 만듭니다.
• 그 후 아이디를 알려주세요.

일정

2주간의 일정으로 진행됩니다. 이 저장소의 자료를 통해서 다음과 같은 지식을 습득합니다.

• Github
• Pheonix WNL
• R https://www.r-project.org/
• Data manipulation
• Data analysis
• Clinical trial PK analysis
• (Optional) Rstudio https://www.rstudio.com/
• Data Science Fun R, 파이썬(Python),
• 데이터 과학 이야기 https://dataninja.me

마지막에 논문 발표를 하게 됩니다.

Subintern 2019-winter

2019-01-07 - 2019-01-18

Participants

• 김자윤 Jayoon-Kim
• 서인석
• 신영하 drshin93
• 박정빈
• 이소희
• 성윤수 yoonsoo940412

Subintern 2018-summer

2018-07-30 - 2017-08-10

Participants

• 조은민 eunmin309
  • 논문 발표: "Comparison of the pharmacokinetics, safety, and immunogenicity of MSB11022, a biosimilar of adalimumab, with Humira(®) in healthy subjects." Br J Clin Pharmacol. 2016 Oct;82(4):983-93. doi: 10.1111/bcp.13039. Slideshare

Subintern 2018-winter

임상약리학과 서브인턴 2018 겨울 과정입니다.

Participants

• 최민아 minah1029
• 현태환 hyuntaehwan
• 최광희 nanckh
• 박현수 phs911221
• 박유라 yurapark
• 최백용 revolugene

Subintern 2017

2017-07-31 - 2017-08-11

Curriculum

• 2017-08-08 Joint R&D Program 워크숍 프로그램 - 그랜드 인터컨티넨탈 서울 파르나스 국화룸

Participants

• 조하혜 firstjhh

Final Presentation

TBD

Subintern 2016

2016-08-01 - 2016-08-12

Participants

• 이종희 jennylee9085
  • 논문 발표: Cardiovascular pharmacogenomics Slideshare
• 어지안 harooyan94
  • 논문 발표: Pharmacogenetics of CYP2D6 and Tamoxifen therapy Slideshare

subintern's Issues

필수 소프트웨어

여러분 환영합니다.

안녕하십니까? 임상약리학과 전공의 한성필입니다.

실습 시에 몇가지 소프트웨어를 설치 했으면 좋겠습니다.

일반적인 컴퓨터 툴

• R (설치) https://cran.r-project.org
• Rstudio (설치) https://rstudio.com
• Acroedit (설치)

약동학 분석

• Phoenix WinNonLin (설치 안해도 됨)

논문작성

• Endnote
• Zotero
• MS Word

2018년 8월 서브인턴

조은민 선생님 @eunmin309 환영합니다.

2018년 서브인턴 일정을 아래처럼 댓글로 기록해 주십시오. 2-3일 주기로 업데이트 하면 좋을 것 같습니다.

dplyr, ggplot2를 활용한 자료 분석

@Jayoon-Kim @Schu1121 @drshin93 @maronbam @mintnia @yoonsoo940412 선생님들께

어제 보여드렸던 dplyr을 활용해서 간단하게나마 자료 분석을 하고 ggplot2로 그림을 그리고 이를 Rmarkdown 파일로 제출해 주세요. 어떤 종류의 분석이든 상관 없고 여러분끼리 상의해서 해도 좋습니다. 😃 결과를 아래 댓글로 달아주세요.
감사합니다.

한성필 드림

• 기한: 2019-01-16 출근 전
• 자료: moonBook::acs acs.xlsx 첨부파일 참고하세요. readxl::read_excel('acs.xlsx')
• 참고자료
  • dplyr의 소개
  • ggplot2의 소개- 뒤쪽에 있음
  • 한성필의 Rmarkdown 코드 파일
  • 한성필의 Rmarkdown 결과

2019년 1월 서브인턴 - 일정 및 공지

환영합니다.

2019년 서브인턴 일정 및 진행상황을 아래에 댓글로 기록해 주십시오.

이름	Github ID	학년
한성필	@shanmdphd	0
김자윤	@Jayoon-Kim	2
서인석	@Schu1121	2
신영하	@drshin93	3
박정빈	@maronbam	3
이소희	@mintnia	2
성윤수	@yoonsoo940412	3

2018년 1월 서브인턴

2018년 1월 서브인턴이 시작되었습니다.

전공의 교육

• NonCompart R 패키지, WinNonLin을 사용한 약동학 비구획분석 (NonCompartmental Analysis, NCA)
• Clinical Study Report (CSR)의 appendix 작성법 (rtf, ReporteRs, Rmarkdown 등을 사용)
• Reproducible research tools (Rmarkdown, knitr, LaTeX 등)
• VCS(Version Control System - SVN, git) 사용법 - github.com 사용법
• R을 사용한 참고문헌 관리, 의학논문작성 (bookdown 패키지 활용)
• R Shiny App 만드는 법, Edison App 만드는 법
• R과 Prism을 사용한 초급 의학 통계 / 1시간
• Word, Endnote를 사용한 의학 논문 작성법 Hands-on (랩탑 필요) / 1시간
• Precision Medicine - Cardiovascular drugs 임형석 교수님 Journal Review 발표자료 / 30분
• 해외 실습/연수 나가는 법 (정보 얻기, Email 쓰기) / 15분
• 의대생을 위한 클라우드 저장소(PC & App) 활용법 (Simplenote, Evernote, Google Drive, Dropbox, Github 등) / 30분
• AMC 인턴 되는 법, 인턴 점수 잘 받는 법 / 15분

2017년 8월 서브인턴

2017년 서브인턴 실습이 시작되었습니다.
조하혜 선생님 @firstjhh 이 2주간 실습할 것입니다.

• 2017-07-31 월 - 서브인턴 시작, 공통강의
• 2017-08-01 화 - 오전: 임상시험 참관; 오후: 임교수님 강의
• 2017-08-02 수 - 오전: 임상시험 참관, 한성필- 'R, Rmarkdown 강의'
• 2017-08-03 목 -
• 2017-08-04 금 -
• 2017-08-07 월 - 오전: Progress Meeting, 한성필- 'NCA by R 강의' ; 오후: 윤석규- 'dplyr, tidyr 강의', Progress Meeting
• 2017-08-08 화 - 오전: 임상시험 참관; 오후: 컨퍼런스 참석
• 2017-08-09 수 - 오전: 임상시험 참관, 한성필- 'WebEx 사용법 강의' ; 오후: 임형석 교수님 강의, 조하혜- WebEx 발표 '면역항암제', 간담회 (회식)
• 2017-08-09 목 - 학교 일정

논문 작성을 위한 R 통계분석 쉽게 배우기

논문 작성 R 교재를 메일로 보내드리려고 했는데 파일이 너무 커서 내일 USB를 가져 오면 공유하도록 하겠습니다.

@minah1029
@hyuntaehwan
@nanckh
@phs911221
@yurapark
@revolugene

한성필