patreo_dengue's Introduction

PATREO-Dengue

Repositório com implementações do projeto "Uso de sensoriamento remoto e inteligência artificial para prever áreas com alto risco de infestação por Aedes aegypti e arboviroses" em parceria PATREO/DCC-UFMG e FSP-USP.

Diretórios

Codigos/paper_PLOS_2024: referente ao paper Automatic mapping of high-risk urban areas for Aedes aegypti infestation based on building facade image analysis publicado na PLOS One em 2024.
- facades.ipynb: Notebook principal com o treinamento k-fold e extração de métricas resultado. Treinamento e testes realizados nas fotos tiradas por agentes de saúde pública.
- inferencias_5classes.csv: inferências do PCI 5 classes sobre as fotos dos agentes de saúde (separados por fold).
- models/folds.dict: dicionário com as amostras associadas a cada fold
- models/best_fold0*.pt: modelo treinado em cada um dos folds listados em folds.dict.
- results/activations*.pdf: distribuição de ativações para diferentes cenários (por fold, por classe, etc.)
- results/cm_fold0*.pdf: matrizes de confusão por fold.
- streetview/data.ipynb: exploração de dados das imagens coletadas via streetview e rotuladas por agentes de saúde.
- streetview/inference.ipynb: Pipeline de inferência com os modelos treinados nas fotos dos agentes de saúde, aqui testados nas imagens coletadas do streetview.
- streetview/inferences.csv: inferências com os 5 diferentes modelos sobre as imagens do streetview.

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