scossin/romediapp

Set of programs on top of the Romedi terminology

romediapp's Issues

Positions

Bonjour , je suis en train d'utiliser votre code pour repérer des médicaments dans un corpus. J'avais juste 2 questions .
Premièrement, est-ce normal que pos_end - pos_start donne la len(médicament) - 1 ?
Deuxièmement, quel est l'encoding des inputs text ? Je compare les start/pos des médicaments de mon algorithme avec les votre et il y a un énorme décalage, je me suis dit que c'était peut être une histoire d'encoding.

Je suis sûr que vous allez pouvoir m'éclairer sur ces deux questions
merci pour votre travail
Nicolas O

absence de detection

• vitamine B9 => ajouter synonyme acide folique
• ipratropium => http://www.romedi.fr/romedi/INkfr4vk15onhd8ijpn4m97aht5b7i1ifg absence de détection

Wikidata URI

Add Wikidata URI in the graph.

RomediSPARQLAPI version change but not in the code example

Hi,
you need to change the code api from urlLink = "http://www.romedi.fr:8892/RomediSPARQLAPI-0.0.1-SNAPSHOT/GetJSONbyIRI"
to urlLink = "http://www.romedi.fr:8892/RomediSPARQLAPI-0.1.0/GetJSONbyIRI" in the codeExample folder

Best

README/installation

Missing infos in the README / help to install ROMEDI.

• http://www.romedi.fr/telechargement.html does not work ("Cannot GET /telechargement.html" error)
• need to mkdir ttl/ folder in data/ before downloading ROMEDI turtle file
• mvn clean package should be launch from the base folder (no more data/)
• once the services are started, one needs to update the .ttl file into the BlazeGraph (i.e. it seems there is no automatic reading of the datas from the data/ttl/ folder by BlazeGraph)

Testing Platform : Ubuntu

Thank you, cheers !

Typo RcodeExample.R

Line 10 triplestore = "http://127.0.0.1:8889" ==> "http://www.romedi.fr:8889"