skodapetr/statsview

Deprecated

This repository is no longer maintained.

StatsView

A prototype implementation of samtools stats data.

statsview's Issues

ACGT visualisation

Obdelnik vyplneny ctyrmi barevnymi pruhy (dava to smysl, soucet dohromady musi davat 100%). Mys zobrazuje jako ted svislou caru a u kazdeho pruhu se zobrazuje.

Optimalizovat velikost výsledného souboru

Mělo by to být pod 1MB.

Relevantní odkazy:

• https://bootstrap-vue.js.org/docs/misc/third-party/#icons

Přidat indikátor nahrávání souborů

Pokud se nahrává hodně souborů není poznat kdy nahrání proběhlo, zároveň se dynamicky mění seznam, což není žádoucí.

Testováno při načítání jednoho tisíce souborů.

Podpora více souborů

• Umožnit importovat více souborů (drag & drop a select)
• Pomocí page-up/down měnit soubory
• Přidat na levou stranu menu se seznamem souborů

Přidat podporu chybějících dat

V datech mohou chybět data (FFQ, .. ) je třeba zobrazit informaci, že data chybí.

Pohyb šipkami v seznamu grafů

Umožnit používat šipky k navigaci mezi grafy.

Přidat graf gc_depth

https://github.com/samtools/samtools/blob/develop/misc/plot-bamstats#L935

Quality III

Zobrazit popisek hodnot (jako u ostatních grafů) jen pro linku na kterou jsem najel myší.

Add readme file

Add build (npm ci) & dev instructions.

Quality visualisation

We can use something like http://bl.ocks.org/rkirsling/33a9e350516da54a5d4f

Přidat vědeckou notaci pro čísla na osách

Zejména osa Y.

ACGT visualisation

Ctyri cary jako v puvodni verzi. Vizualne by asi pomohlo zobrazit pod daty grid, jako napr. tady http://www.cotrino.com/wp-content/uploads/2013/05/starpaths_directors-1024x625.jpg .

Zvážit použití dynamického layoutu

Resources to consider:

• https://gridstackjs.com/
• gridstack/gridstack.js#791
• Top 5: Best Draggable, Droppable and Resizable Grid Layout Designer jQuery and JavaScript Plugins
• https://haltu.github.io/muuri/
• https://github.com/jbaysolutions/vue-grid-layout

Přidat možnost zvětšení (přiblíže) po ose X

Ideální by bylo ukázat i kontext celého grafu v nějakém náhledu, třeba pod grafem.

Upravit vzorová data pro Quality 2

Graf není příliš přehledný a hodnoty zabírají hodně místa, řešením by mohlo být zaokrouhlení nebo vyhlazení při zachování hlavních charakteristik.

Přidat margin do konfigurace

Rozsahy grafů

Nastavit fixní rozsahy grafů jako soft. max.
Quality II - 0 - 50
ACGT - 0 - 100

Upravit menu na levé straně

Umožnit menu schovat, případně zobrazit více menu vedle sebe (příklad u zobrazení seznamu soubor a seznamu grafů).