BWT 를 활용한 Bowtie algorithm
reference dna 파일 다운로드
wget http://skyrich3.synology.me/~Huni/chr1.fna
- 폴더에서 bwt_index_table 와 reference_dna 파일을 가져옵니다. (.txt 파일로 변환해서 써야함)
- main.cpp 에서 n, m, l 값 조정
- BWT_outer.cpp 에서 외부정렬시 사용할 파일 개수 설정
- BW matrix 가 완성되면, BWT_outer.cpp 241번째 줄 주석처리 하여 사용