trellixvulnteam/bayesoptimization_vm29

贝叶斯优化搜索聚合物链结构极值热导率

COMmon Bayesian Optimization Library ( COMBO )

Usage

After installation, you can launch the test suite from 'examples/grain_bound/tutorial.ipynb'.

License

This package is distributed under the MIT License.

一、随机搜索序列

1.全局序列号描述符文件生成（遍历目录文件名生成）

2.前两次搜索采用随机的方式，每次搜索20个结构

3.将搜索结果传入模拟函数中，再将模拟器返回的热导率值一并传入贝叶斯模型中

二、批量提交任务

1.根据搜索结果，调用另外一个批量提交任务的接口，实现过程如下：

三、计算热导率

1.修改Main_thermal_conductivity3.0.py，计算两个case，最后求平均

• 增加如下代码

2.批量运行Main_thermal_conductivity3.0.py，返回每个结构的平均热导率

四、贝叶斯第一次训练

• 每次优化过程记录优化时间
• 第一次训练耗时：114s

五、程序整体思路

1.加载描述符文件

2.新建结构文件及时间日志文件

3.将模拟器类属性值初始化为out文件中的格式，仅存入第一列，并全部置为0，后续位置上有值再进行原地修改

4.贝叶斯搜索结构序列号索引值

5.将搜索值存入input_Descriptor中

6.将热导率序列按序保存到self.t矩阵中

7.保存更新后的输出矩阵，并返回更改位置的热导率值，并传入policy中