在本地无法运行腹部分割dense_vnet_abdominal_ct模型

[Yu-Yuanyuan]

在本地无法运行腹部分割dense_vnet_abdominal_ct模型

[MingruiZhuang]

dense_vnet这个神经网络例子实际上是Niftynet框架的一个示例，您可以参考Niftynet中该示例的说明：https://github.com/NifTK/NiftyNetModelZoo/blob/master/dense_vnet_abdominal_ct_model_zoo.md
并按照Nitynet说明书中的方法来配置环境。

如果无法确定具体的原因，可以直接在软件里运行这个功能，软件会在./Plugins/_datacacke/路径下生成临时文件ParentImage。然后通过控制台直接运行./Plugins/DP_dense_vnet_abdominal_ct.py，查看报错来知道具体的原因。

我个人配置环境的方法如下（两个例子都可以运行），希望能有帮助：
python 3.6 (勾选加入环境变量)
conda install python=3.6.0 (如果是anaconda)
pip install tensorflow==1.7
pip install keras
pip install niftynet
pip install SimpleITK
pip install opencv-python
pip install scikit-image
pip install vtk
pip uninstall scipy
pip install scipy==1.1.0

安装好Niftynet后，可以用下面的方法测试：
net_download dense_vnet_abdominal_ct_model_zoo
net_segment inference -c ~/niftynet/extensions/dense_vnet_abdominal_ct/config.ini

希望能帮到您。