dlutmedimggroup/anatomysketch-software

A medical image segmentation software supporting user interventions and user-defined funtion extention

anatomysketch-software's Issues

请问运行分割后的结果在3D视图中可以三维显示吗

现在正常运行了 dense_vnet_abdominal_ct进行分割，3D视图中出现了相应的分割结果
但我希望把每个分割出的器官以三维形式进行显示，而不是得到贴合在横截面、矢状面、冠状面上的二维图像
看了下帮助文档，是只能使用[convert to mesh]吗，
但我并不知道分割出的每个器官灰度阈值范围，在这种情况下还可以将分割出的器官三维显示吗？

编译问题

请问您用的 vtk 哪个版本？我编译源码时提示无法找到”vtkDicomDirectory.h“这个头文件，而我从vtk官网上也没有查到有该类，似乎是另外某个外部库的内容，但我没找到是什么。同样还有”vtkDICOMItem.h“等。

Program flashback

1. Open a *.mhd file;
2. 新建分割;
3. Select "Contour_Interpolation", and Target set as "新建轮廓线", Smooth as "1.00";
4. Draw coutour line on the axial section;
5. Click "计算"
   →Program flashback.

python解释器问题

您好，我想请问一下，该软件调用python的时候是默认用哪个解释器，我想让它调用aconada创建出来的虚拟环境的解释器需要改哪个部分？

请问如何引用AnatomySketch-Software，是由有相关文献？

请问如何引用AnatomySketch-Software，是否有相关文献？

在本地无法运行腹部分割dense_vnet_abdominal_ct模型

您好，下载了AS软件的release版本和dense_vnet_abdominal_ct.zip，解压后放入Plugins文件夹中，发现将自带的dense_vnet_abdominal_ct\dense_vnet_abdominal_ct\TempFiles\TEMP_niftynet_out.nii.gz文件删去之后，无法在本地电脑上调用模型生成分割标记预测

本地电脑配置有tensorflow和keras，想问下您的tensorflow版本是什么，然后调用模型生成TEMP_niftynet_out.nii.gz的代码是在哪一部分，求回复呀